ФНС России в письме от 11.04.2014 № ЕД-4-15/6831 указало, что если налогоплательщик подаст декларацию по НДС в срок, но не в электронном виде, а на бумажном носителе, то обязанность по сдаче декларации будет считаться исполненной. В то же время в письме указано, что привлечь к ответственности за поданную в срок декларацию на бумаге налоговая сможет только по статье 119.1 НК РФ, то есть за нарушение требований статьи 174 НК РФ к формату.  Штраф по статье 119 НК РФ организации в этом случае не грозит.
Однако если бумажная декларация по НДС подана с нарушением срока, то это обернется штрафами сразу по двум основаниям: за нарушение способа подачи (ст. 119.1 НК РФ) и за нарушение срока (ст. 119 НК РФ).